Агатов - один из героев фильма "Иду на грозу", который предстает перед зрителем в отрицательном ключе: он противодействует главному герою, Сергею Крылову, на пути к достижению его цели. Агатов показан нам карьеристом, который заботится о собственном продвижении в службе больше, чем о научных исследованиях. Тем самым он кардинально отличается от его товарищей, других ученых, живущих своими научными идеями годами и даже десятилетиями. Агатов вставляет палки в колеса Крылову уже с самого начала своей карьеры, в результате этого молодой ученый уходит из института. Этот герой готов совершать подлости ради своих целей, и он их совершает.

Итак, мы можем сказать, что Яков Агатов - отрицательный персонаж, выбивающийся из того обобщенного образа советского ученого, который мы составили на основе просмотренных фильмов. Этот герой, в противовес другим ученым, думает лишь о себе. Ему не важна ни наука, ни окружающие люди. Он равнодушен ко всему, кроме собственной карьеры.